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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5mmje_ | 3.65 | PDB header: ribosome | Chain: E: PDB Molecule: |
Added to library: Thu Feb 9 21:47:02 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | G | N | D | V | Y | A | M | D | S | K | I | K | K | A | T | G | F | G | S | K | S | K | K | E | K | I | R | D | G | F | E | E | N | V | V | Q | V | R | R | V | T | K | V | V | K | G | G | K | H | M | R | F | R | A | I | V | V | V | G | D | K | K | G | Q | V | G | V | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | K | A | K | E | V | V | S | A | V | Q | K | A | A | V | D | A | R | R | N | I | I | T | V | P | M | T | K | Y | L | T | F | P | H | R | N | E | A | D | Y | G | A | A | R | V | M | L | R | P | A | A | P | G | T | G | V | I | A | G | G | A | V | R | T | V | L | E | M | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | B | S | S | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | V | E | N | A | L | G | K | Q | L | G | S | N | N | A | L | N | N | A | R | A | T | I | V | A | V | Q | T | M | R | Q | F | S | D | V | A | R | D | R | G | I | P | M | E | E | L | W | K | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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