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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5mmiS_ | 3.25 | PDB header: ribosome | Chain: S: PDB Molecule: 50s ribosomal protein l21, chloroplastic; |
Added to library: Thu Feb 9 14:21:53 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | K | A | E | F | E | E | F | Q | R | P | P | N | Q | K | P | Q | L | S | D | V | L | P | D | D | F | Q | A | P | E | P | G | T | P | E | Y | N | D | I | I | N | Q | F | L | P | K | K | G | P | P | P | P | R | E | E | I | F | A | V | V | V | I | G | S | R | Q | Y | I | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | G | R | W | I | Y | T | Q | R | L | K | G | A | T | V | N | D | K | I | V | L | N | K | V | L | L | V | G | T | K | A | S | T | Y | I | G | T | P | I | V | T | N | A | A | V | H | A | V | V | E | E | Q | L | L | D | D | K | V | I | V | F | K | Y | K | K | K | K | N | Y | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | ||||||||||||||||||||||
Sequence | R | N | I | G | H | R | Q | P | I | T | R | I | K | I | T | G | I | T | G | Y | E | D | Y | P | A | S | T | L | E | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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