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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5mkcB_ | 2.04 | PDB header: cell adhesion | Chain: B: PDB Molecule: cell wall surface anchor family protein (jo),cell wall |
Added to library: Sat Mar 18 08:30:04 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Y | P | Q | T | G | T | Y | P | D | V | Q | T | P | Y | Q | I | I | K | V | D | G | S | E | K | N | G | Q | H | K | A | L | N | P | N | P | Y | E | R | V | I | P | E | G | T | L | S | K | R | I | Y | Q | V | N | N | L | D | D | N | Q | Y | G | I | E | L | T | V | S | G | K | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | Y | E | T | E | K | K | S | I | E | N | G | T | I | T | D | P | M | G | E | L | I | D | L | Q | L | G | T | D | G | R | F | D | P | A | D | Y | T | L | T | A | N | D | G | S | R | L | E | N | G | Q | A | V | G | G | P | Q | N | D | G | G | L | L | K | N | A | K | V | L | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | D | T | T | E | K | R | I | R | V | T | G | L | Y | L | G | T | D | E | K | V | T | L | T | Y | N | V | R | L | N | D | E | F | V | S | N | K | F | Y | D | T | N | G | R | T | T | L | H | P | K | E | V | E | Q | N | T | V | R | D | F | P | I | P | K | I | R | D | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | T | T | T | T | T | S | B | S | S | S | B | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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