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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5miyA_ | 1.72 | PDB header: ligase | Chain: A: PDB Molecule: e3 ubiquitin ligase ravn; |
Added to library: Sat May 26 08:21:18 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | A | M | G | S | M | P | T | Y | F | D | P | I | M | Q | E | D | T | V | L | D | E | N | T | I | V | Y | L | V | K | I | G | D | N | K | F | S | I | K | A | I | S | S | G | L | E | H | L | P | S | D | P | T | T | H | A | E | K | Y | W | P | I | P | A | K | S | L | I | D | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | S | S | N | K | L | L | F | E | E | D | K | L | T | N | Q | P | I | S | K | D | Q | V | I | E | L | F | A | V | D | P | D | K | T | E | P | K | Q | F | S | D | S | V | K | R | E | L | T | E | N | W | A | R | E | V | L | Q | D | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | B | S | S | S | B | B | S | B | S | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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