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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5m9nA_ | 1.95 | PDB header: structural protein | Chain: A: PDB Molecule: tudor domain-containing protein 1; |
Added to library: Thu Feb 9 13:29:17 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | I | V | V | D | K | S | D | L | I | P | K | V | L | T | L | N | V | G | D | E | F | C | G | V | V | A | H | I | Q | T | P | E | D | F | F | C | Q | Q | L | Q | S | G | R | K | L | A | E | L | Q | A | S | L | S | K | Y | C | D | Q | L | P | P | R | S | D | F | Y | P | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | T | T | T | T | G | G | G | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | D | I | C | C | A | Q | F | S | E | D | D | Q | W | Y | R | A | S | V | L | A | Y | A | S | E | E | S | V | L | V | G | Y | V | D | Y | G | N | F | E | I | L | S | L | M | R | L | C | P | I | I | P | K | L | L | E | L | P | M | Q | A | I | K | C | V | L | A | G | V | K | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | G | G | G | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . |
Sequence | S | L | G | I | W | T | P | E | A | I | C | L | M | K | K | L | V | Q | N | K | I | I | T | V | K | V | V | D | K | L | E | N | S | S | L | V | E | L | I | D | K | S | E | T | P | H | V | S | V | S | K | V | L | L | D | A | G | F | A | V | G | E | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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