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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5lq6A_ | 1.48 | PDB header: immunosuppressant | Chain: A: PDB Molecule: virulence protein vsde; |
Added to library: Thu Feb 9 12:22:42 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | S | Q | D | I | I | S | R | I | N | S | K | N | I | N | N | N | D | S | N | E | V | K | R | I | K | D | A | L | S | I | E | L | Y | P | Q | N | L | S | R | D | N | L | K | Q | M | A | R | Y | V | N | N | C | V | L | L | S | A | C | L | H | Y | N | I | H | H | R | Q | D | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | S | S | K | L | D | S | A | I | V | D | K | I | I | F | G | H | E | L | N | Q | S | Y | S | L | N | S | I | D | E | V | E | K | E | I | L | N | R | Y | D | I | K | R | E | S | S | F | I | I | S | A | E | N | Y | I | A | P | I | I | G | E | S | R | H | D | F | N | A | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | B | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | I | S | E | Y | D | K | K | P | Y | V | Q | F | I | D | S | W | K | T | S | N | I | L | P | S | L | Q | E | I | K | K | H | F | S | S | S | G | E | F | Y | V | R | A | Y | D | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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