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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5lf9A_ | 1.45 | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: nucleoside diphosphate-linked moiety x motif 22; |
Added to library: Sat Aug 5 08:28:32 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | D | P | E | V | T | L | L | L | Q | C | P | G | G | G | L | P | Q | E | Q | I | Q | A | E | L | S | P | A | H | D | R | R | P | L | P | G | G | D | E | A | I | T | A | I | W | E | T | R | L | K | A | Q | P | W | L | F | D | A | P | K | F | R | L | H | S | A | T | L | A | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | B | G | G | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | G | S | R | G | P | Q | L | L | L | R | L | G | L | T | S | Y | R | D | F | L | G | T | N | W | S | S | S | A | A | W | L | R | Q | Q | G | A | T | D | W | G | D | T | Q | A | Y | L | A | D | P | L | G | V | G | A | A | L | A | T | A | D | D | F | L | V | F | L | R | R | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | Q | V | A | E | A | P | G | L | V | D | V | P | G | G | H | P | E | P | Q | A | L | H | Q | D | L | A | G | Q | L | V | V | H | E | L | F | S | S | V | L | Q | E | I | C | D | E | V | N | L | P | L | L | T | L | S | Q | P | L | L | L | G | I | A | R | N | E | T | S | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | G | G | G | B | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | A | S | A | E | F | Y | V | Q | C | S | L | T | S | E | Q | V | R | K | H | Y | L | S | G | G | P | E | A | H | E | S | T | G | I | F | F | V | E | T | Q | N | V | R | R | L | P | E | T | E | M | W | A | E | L | C | P | S | A | K | G | A | I | I | L | Y | N | R | V | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | G | G | G | S | S | S | T | T | G | G | G | S | T | T | G | G | G | B | T | S |   | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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