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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ldwO_ | 4.27 | PDB header: oxidoreductase | Chain: O: PDB Molecule: nadh dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit |
Added to library: Thu Feb 9 11:15:13 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | G | N | S | Y | R | L | Q | A | W | L | Y | A | S | R | L | L | Q | Y | A | D | A | L | E | H | L | L | S | T | G | Q | G | V | V | L | E | R | S | I | Y | S | D | F | V | F | L | E | A | M | Y | R | Q | G | F | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | K | Q | C | V | D | H | Y | N | Q | V | K | K | V | T | I | C | E | Y | L | P | P | H | V | V | V | Y | V | D | V | P | V | P | E | V | Q | S | R | I | Q | K | K | G | N | P | H | E | M | K | I | T | S | A | Y | L | Q | D | I | E | N | A | Y | K | G | T | F | L | P | E | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | E | K | C | E | V | L | Q | Y | S | A | W | E | A | Q | D | A | E | K | V | V | E | D | I | E | Y | L | K | Y | D | K | G | P | W | L | D | Q | N | D | R | N | L | H | K | L | R | M | L | V | Q | D | K | L | E | V | L | N | Y | T | S | I | P | V | F | L | P | E | V | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | G | A | H | Q | S | D | Q | V | F | Q | E | F | T | E | L | P | G | R | K | Y | R | A | G | Y | N | E | D | V | G | D | K | W | I | W | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T |
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