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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5l2xA_ | 2.20 | PDB header: transferase/dna | Chain: A: PDB Molecule: dna-directed primase/polymerase protein; |
Added to library: Thu Feb 9 11:50:04 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | N | R | K | W | E | A | K | L | K | Q | I | E | E | R | A | S | P | E | E | P | P | S | I | W | R | L | F | H | R | Q | A | Q | A | F | N | F | V | K | S | C | K | E | D | V | H | V | F | A | L | E | C | K | V | G | D | G | Q | R | I | Y | L | V | T | T | Y | A | E | F | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | Y | Y | K | S | R | K | N | L | L | H | C | Y | E | V | I | P | E | N | A | V | C | K | L | Y | F | D | L | E | F | N | K | P | A | N | P | G | A | D | G | K | K | M | V | A | L | L | I | E | Y | V | C | K | A | L | Q | E | L | Y | G | V | N | C | S | A | E | D | V | L | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | B | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | D | S | S | T | D | E | K | F | S | R | H | L | I | F | Q | L | H | D | V | A | F | K | D | N | I | H | V | G | N | F | L | R | K | I | L | Q | P | A | L | D | L | L | P | D | L | S | F | L | V | V | K | N | N | M | G | E | K | H | L | F | V | D | L | G | V | Y | T | R | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | S | S | B | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . |
Sequence | R | N | F | R | L | Y | K | S | S | K | I | G | K | R | V | A | L | E | V | T | E | D | N | K | F | F | P | I | Q | S | K | D | V | S | D | E | Y | Q | Y | F | L | S | S | L | V | S | N | V | R | F | S | D | T | L | R | I | L | T | C | E | P | |||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | B | T | T | B | B | T | T | T | T | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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