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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5l0yE_ | 2.87 | PDB header: protein transport | Chain: E: PDB Molecule: sec72-ssa1 c-terminal peptide fusion protein; |
Added to library: Sat Mar 25 09:33:38 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | K | R | S | A | N | I | N | K | L | R | E | S | G | N | A | E | Y | R | K | Q | R | Y | G | D | A | I | K | L | Y | T | L | G | L | Q | M | A | L | T | R | P | A | W | E | P | A | G | L | V | R | D | E | I | H | Q | L | Y | S | N | R | A | Q | A | Y | M | Q | L | G | Q | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | E | A | A | A | D | A | E | C | S | V | E | A | K | R | Q | G | N | A | K | A | W | Y | R | R | G | K | C | L | M | E | M | R | R | L | Q | E | A | R | E | W | V | A | R | G | L | E | F | E | E | K | E | L | A | E | L | L | K | E | I | D | S | K | L | A | A | E | K | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | D | A | H | P | T | V | E | E | V | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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