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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5l0wB_ | 3.04 | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: sec72; |
Added to library: Sat Mar 25 09:11:35 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | T | F | T | F | I | P | L | H | I | D | P | K | S | K | A | I | S | A | A | P | N | A | L | G | T | P | S | A | N | K | A | L | E | T | E | L | A | A | L | N | A | L | H | R | A | L | H | T | Q | I | E | G | P | I | P | V | P | P | P | P | V | P | V | N | P | K | R | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | I | N | K | L | R | E | S | G | N | A | E | Y | R | K | Q | R | Y | G | D | A | I | K | L | Y | T | L | G | L | Q | X | A | L | T | R | P | A | W | E | P | A | G | L | V | R | D | E | I | H | Q | L | Y | S | N | R | A | Q | A | Y | X | Q | L | G | Q | W | P | E | A | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | D | A | E | C | S | V | E | A | K | R | Q | G | N | A | K | A | W | Y | R | R | G | K | C | L | X | E | X | R | R | L | Q | E | A | R | E | W | V | A | R | G | L | E | F | E | G | E | E | K | E | L | A | E | L | L | K | E | I | D | S | K | L | A | A | E | K | A | S | R | D | |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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