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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ku7B_ | 2.30 | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: tir-nb-lrr type resistance protein rpv1; |
Added to library: Thu Feb 23 10:13:01 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | T | Y | D | V | F | L | S | F | R | G | E | D | T | R | Y | N | F | T | D | H | L | Y | S | A | L | G | R | R | G | I | R | T | F | R | D | D | R | L | R | R | G | E | A | I | A | P | E | L | L | K | A | I | E | E | S | R | S | S | V | I | V | F | S | E | N | Y | A | H | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | W | C | L | D | E | L | V | K | I | M | E | C | Q | K | D | L | G | H | A | V | F | P | I | F | Y | H | V | D | P | S | H | V | R | K | Q | E | G | S | F | G | E | A | F | A | G | Y | E | E | N | W | K | D | K | I | P | R | W | R | T | A | L | T | E | A | A | N | L | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | W | H | L | L | D | D | R | Y | E | S | N | Q | I | K | E | I | T | N | S | I | F | R | Q | L | K | C | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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