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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5kteA_ | 3.94 | PDB header: transport protein/immune system | Chain: A: PDB Molecule: divalent metal cation transporter mnth; |
Added to library: Thu Feb 9 11:58:30 2017 | |
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Sequence | F | L | G | P | A | V | I | A | S | I | A | Y | M | D | P | G | N | F | A | T | N | I | E | G | G | A | R | Y | G | Y | S | L | L | W | V | I | L | A | A | N | L | M | A | M | V | I | Q | N | L | S | A | N | L | G | I | A | S | G | R | N | L | P | E | L | I | R | E | R | W | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | G | G | G | G | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | P | L | V | W | F | Y | W | I | Q | A | E | L | V | A | M | A | T | D | L | A | E | F | L | G | A | A | L | A | I | Q | L | L | T | G | L | P | M | F | W | G | A | V | V | T | G | V | V | T | F | W | L | L | E | L | A | V | G | A | F | V | L | M | I | G | V | A | Y | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | V | V | L | A | R | P | D | L | A | A | V | G | A | G | F | V | P | R | L | Q | G | P | G | S | A | Y | L | A | V | G | I | I | G | A | T | V | M | P | H | V | I | Y | L | L | N | R | V | D | V | I | A | A | M | G | L | A | G | L | I | N | M | S | M | L | A | V | A | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | F | H | G | K | N | V | E | N | A | G | D | L | T | T | A | Y | Q | T | L | P | A | A | S | V | L | F | A | V | A | L | L | A | S | G | L | S | S | S | A | V | G | T | M | A | G | D | V | I | M | Q | G | R | L | I | T | M | L | P | A | F | I | V | I | L | L | G | M | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | G | G | G | S | S | S | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G | S | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | S | S | V | L | I | L | S | Q | V | I | L | C | F | G | V | P | F | A | L | V | P | L | L | L | F | T | A | H | H | D | V | M | G | A | L | V | T | R | R | S | F | T | V | I | G | W | V | I | A | V | I | I | I | A | L | N | G | Y | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T |
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