| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5ko9A_ | 1.50 | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: embryonic stem cell-specific 5-hydroxymethylcytosine- |
Added to library: Thu Feb 9 14:59:24 2017 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | C | G | R | T | S | C | H | L | P | R | D | V | L | T | R | A | C | A | Y | Q | D | R | R | G | Q | Q | R | L | P | E | W | R | D | P | D | K | Y | C | P | S | Y | N | K | S | P | Q | S | N | S | P | V | L | L | S | R | L | H | F | E | K | D | A | D | S | S | E | R | I | I | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | G | G | G | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | M | R | W | G | L | V | P | S | W | F | K | E | S | D | P | S | K | L | Q | F | N | T | T | N | C | R | S | D | T | V | M | E | K | R | S | F | K | V | P | L | G | K | G | R | R | C | V | V | L | A | D | G | F | Y | E | W | Q | R | C | Q | G | T | N | Q | R | Q | P | Y | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | G | G | G | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | Y | F | P | Q | I | E | K | V | W | D | N | W | R | L | L | T | M | A | G | I | F | D | C | W | E | P | P | E | G | G | D | V | L | Y | S | Y | T | I | I | T | V | D | S | C | K | G | L | S | D | I | H | H | R | M | P | A | I | L | D | G | E | E | A | V | S | K | W | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | |||||||||
Sequence | F | G | E | V | S | T | Q | E | A | L | K | L | I | H | P | T | E | N | I | T | F | H | A | V | S | S | V | V | N | N | S | R | N | N | T | P | E | C | L | A | P | V | A | |||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | B | G | G | G | G | S | T | T | S | G | G | G | G | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|