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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5k1sD_ | 2.55 | PDB header: oxidoreductase | Chain: D: PDB Molecule: oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family; |
Added to library: Thu Feb 9 13:45:53 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | H | M | K | A | V | V | L | R | S | F | G | G | N | L | K | M | E | T | M | P | M | P | R | P | G | R | G | E | V | L | L | R | V | H | A | C | G | V | C | Y | H | D | V | I | N | R | R | G | L | G | H | E | A | A | G | E | V | I | E | V | G | P | D | T | P | G | W | K | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | D | R | A | A | T | L | Q | R | M | S | C | G | D | C | A | L | C | R | S | G | R | N | S | L | C | K | T | D | N | R | F | F | G | E | E | L | P | G | G | Y | A | Q | F | M | V | A | P | V | G | G | L | G | R | V | P | A | S | L | P | W | N | E | A | A | T | V | C | C | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | S | S | S | T | G | G | G | T | T | B | B | T | T | T | B | S | S | B | S | G | G | G | T | T | S | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | G | T | A | V | H | T | V | R | T | R | G | K | V | R | A | G | E | T | V | L | I | T | G | A | S | G | G | V | G | L | S | S | V | Q | L | A | R | L | D | G | A | R | V | I | A | V | T | S | S | E | A | K | V | Q | A | L | K | E | A | G | A | D | E | V | I | V | S | R | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | D | F | A | S | D | V | R | K | R | T | Q | G | A | G | V | D | V | A | V | E | I | V | G | S | A | T | F | D | Q | T | L | K | S | M | A | P | G | G | R | V | V | V | V | G | N | L | E | S | G | M | V | Q | L | N | P | G | L | V | I | V | K | E | L | E | I | L | G | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | |
Sequence | A | T | T | Q | A | E | L | D | E | A | L | R | L | T | A | T | G | G | V | R | Q | F | V | T | D | A | V | P | L | A | E | A | A | K | A | H | F | R | L | E | N | R | E | V | A | G | R | L | V | L | V | P | P | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | T | T | S | S |
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