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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5jzcG_ | 4.20 | PDB header: dna binding protein | Chain: G: PDB Molecule: dna repair protein rad51 homolog 1; |
Added to library: Thu Feb 9 13:06:49 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | G | P | Q | P | I | S | R | L | E | Q | C | G | I | N | A | N | D | V | K | K | L | E | E | A | G | F | H | T | V | E | A | V | A | Y | A | P | K | K | E | L | I | N | I | K | G | I | S | E | A | K | A | D | K | I | L | A | E | A | A | K | L | V | P | M | G | F | T | T | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | E | F | H | Q | R | R | S | E | I | I | Q | I | T | T | G | S | K | E | L | D | K | L | L | Q | G | G | I | E | T | G | S | I | T | E | M | F | G | E | F | R | T | G | K | T | Q | I | C | H | T | L | A | V | T | C | Q | L | P | I | D | R | G | G | G | E | G | K | A | M | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | T | S | S | B | S | S | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | D | T | E | G | T | F | R | P | E | R | L | L | A | V | A | E | R | Y | G | L | S | G | S | D | V | L | D | N | V | A | Y | A | R | A | F | N | T | D | H | Q | T | Q | L | L | Y | Q | A | S | A | M | M | V | E | S | R | Y | A | L | L | I | V | D | S | A | T | A | L | Y | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | D | Y | S | G | R | G | E | L | S | A | R | Q | M | H | L | A | R | F | L | R | M | L | L | R | L | A | D | E | F | G | V | A | V | V | I | T | N | Q | V | V | A | Q | V | D | P | K | K | P | I | G | G | N | I | I | A | H | A | S | T | T | R | L | Y | L | R | K | G | R | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | - | B | B | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | |||||||||||||||||||
Sequence | E | T | R | I | C | K | I | Y | D | S | P | C | L | P | E | A | E | A | M | F | A | I | N | A | D | G | V | G | D | A | K | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | T | T | S |
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