| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5jxdA_ | 2.03 | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: tumor necrosis factor alpha-induced protein 8; |
Added to library: Sat Jul 1 08:26:13 2017 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | T | D | V | F | N | S | K | N | L | A | V | Q | A | Q | K | K | I | L | G | K | M | V | S | K | S | I | A | T | T | L | I | D | D | T | S | S | E | V | L | D | E | L | Y | R | V | T | K | E | Y | T | Q | N | K | K | E | A | E | R | V | I | K | N | L | I | K | T | V | I | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | V | L | H | R | N | N | Q | F | N | Q | D | E | L | A | L | M | E | K | F | K | K | K | V | H | Q | L | A | M | T | V | V | S | F | H | Q | V | E | Y | T | F | D | R | N | V | L | S | R | L | L | N | E | C | R | E | L | L | H | E | I | I | Q | R | H | L | T | A | K | S | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||
Sequence | G | R | V | N | N | V | F | D | H | F | S | D | S | D | F | L | A | A | L | Y | N | P | F | G | K | F | K | P | H | L | Q | K | L | C | D | G | I | N | K | M | L | D | E | E | N | I | ||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|