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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ip1A_ | 2.70 | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: nucleoprotein; |
Added to library: Sat Mar 25 08:51:26 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | K | V | K | L | T | K | E | N | I | V | A | L | L | T | Q | G | K | D | L | E | F | E | E | N | Q | N | L | V | A | F | N | F | K | T | F | C | L | E | N | L | D | Q | I | K | K | X | S | I | I | S | C | L | T | F | L | K | N | R | Q | S | I | X | K | V | I | K | Q | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | T | F | G | K | I | T | I | K | K | T | S | D | R | I | G | A | T | D | X | T | F | R | R | L | D | S | L | I | R | V | R | L | V | E | E | T | G | N | S | E | N | L | N | T | I | K | S | K | I | A | S | H | P | L | I | Q | A | Y | G | L | P | L | D | D | A | K | S | V | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | G | G | G | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | A | I | X | L | G | G | S | L | P | L | I | A | S | V | D | S | F | E | X | I | S | V | V | L | A | I | Y | Q | D | A | K | Y | K | D | L | G | I | D | P | K | K | Y | D | T | K | E | A | L | G | K | V | C | T | V | L | K | S | K | A | F | E | X | N | E | D | Q | V | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||
Sequence | G | K | E | Y | A | A | I | L | S | S | S | N | P | N | A | K | G | S | V | A | X | E | H | Y | S | E | T | L | N | K | F | Y | E | X | F | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S |
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