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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5iooA_ | 2.52 | PDB header: unknown function | Chain: A: PDB Molecule: avpa; |
Added to library: Thu Feb 9 22:03:13 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | I | N | R | K | Q | A | K | E | F | Y | N | S | D | X | A | T | A | L | E | S | C | Q | K | Y | G | H | A | L | F | X | P | E | L | I | D | A | K | I | L | A | T | K | G | S | S | L | L | S | N | W | L | T | A | P | S | I | R | A | T | G | R | T | K | Q | G | N | P | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | B | S | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | Y | V | H | V | D | N | Y | L | S | N | P | E | N | I | R | N | A | E | R | I | N | G | A | G | V | X | P | V | D | E | F | Q | R | L | L | D | L | G | D | N | K | N | V | F | V | I | D | Y | D | K | L | K | S | S | S | S | G | V | I | P | V | E | R | A | L | E | H | P | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | T | T | T | S | S | S | T | S | G | G | G | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | T | I | P | F | I | G | G | E | E | R | A | Q | R | Y | L | E | K | F | K | Q | V | Y | G | N | N | I | G | I | W | H | C | D | D | L | K | D | E | P | L | G | R | L | L | F | V | G | D | Y | C | N | N | G | L | I | G | N | Y | G | I | G | N | Y | A | R | F | V | G | V | R | |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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