| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5iipA_ | 2.50 | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: glycine betaine/carnitine/choline abc transporter%2c atp- |
Added to library: Thu Feb 9 11:14:20 2017 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | E | G | V | M | I | K | P | I | T | I | Q | A | E | A | T | L | N | D | A | V | H | I | M | R | Q | K | R | V | D | T | I | F | V | V | D | S | N | N | H | L | L | G | F | L | D | I | E | D | I | N | Q | G | I | R | G | H | K | S | L | R | D | T | M | Q | Q | H | I | Y | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | S | T | S | T | T | B | T | T | S | T | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | |||||
Sequence | Q | I | D | S | K | L | Q | S | V | R | T | I | L | K | R | N | V | R | N | V | P | V | V | D | D | Q | Q | R | L | V | G | L | I | T | R | A | N | V | V | D | I | V | Y | D | T | I | ||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | S | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|