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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5gs5D_ | 1.84 | PDB header: immune system | Chain: D: PDB Molecule: stimulator of interferon genes protein; |
Added to library: Sat Oct 28 08:27:51 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | S | G | E | N | L | Y | F | Q | G | S | H | M | A | P | A | E | V | S | A | V | C | E | E | K | N | F | N | V | A | H | G | L | A | W | S | Y | Y | I | G | Y | L | K | L | I | L | P | G | L | Q | A | R | I | R | M | F | N | Q | L | H | N | N | M | L | S | G | A | G | S | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | S | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | L | Y | I | L | F | P | L | D | C | G | V | P | D | D | L | S | V | A | D | P | N | I | R | F | R | D | M | L | P | Q | Q | N | T | D | R | A | G | V | K | N | R | A | Y | S | N | S | V | Y | E | L | L | E | N | G | Q | P | A | G | A | C | I | L | E | Y | A | T | P | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | L | F | A | M | S | Q | D | G | K | A | G | F | S | R | E | D | R | L | E | Q | A | K | L | F | C | R | T | L | E | E | I | L | A | D | V | P | E | S | R | N | H | C | R | L | I | V | Y | Q | E | S | E | E | G | N | S | F | S | L | S | Q | E | V | L | R | H | I | R | Q | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | A | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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