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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5gs2H_ | 3.59 | PDB header: sugar binding protein/immune system | Chain: H: PDB Molecule: anti-mbp; |
Added to library: Thu Feb 9 16:16:00 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | Q | L | V | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | G | S | L | R | L | S | C | A | A | S | G | F | N | F | S | S | S | S | I | H | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | V | A | S | I | S | S | S | S | G | S | T | S | Y | A | D | S | V | K | G | R | F | T | I | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | D | T | S | K | N | T | A | Y | L | Q | M | N | S | L | T | A | E | D | T | A | V | Y | Y | C | A | R | Y | G | H | W | S | W | G | R | W | W | N | Y | W | V | A | L | D | Y | W | G | Q | G | T | L | V | T | V | S | S | D | I | V | M | T | Q | S | Q | K | F | M | S | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | G | D | R | V | S | I | T | C | K | A | S | Q | N | V | R | T | A | V | A | W | Y | Q | Q | K | P | G | Q | S | P | K | A | L | I | Y | L | A | S | N | R | H | T | G | V | P | D | R | F | T | G | S | G | S | G | T | D | F | T | L | T | I | S | N | V | Q | S | E | D | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | S | B | T | T | T | T | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | Y | F | C | L | Q | H | W | S | Y | P | Y | T | F | G | G | G | T | K | L | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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