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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5gpdA_ | 3.50 | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: sterol regulatory element-binding protein 1; |
Added to library: Thu Feb 9 11:07:04 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | E | N | S | H | A | D | D | V | F | S | P | N | M | V | L | A | K | S | T | R | D | S | A | Q | M | I | I | S | S | L | S | D | V | L | V | L | S | P | L | E | V | L | A | S | W | Y | A | A | D | L | L | D | A | L | L | M | E | S | L | S | R | K | V | E | I | S | E | I | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | G | G | G | G | G | S | G | G | G | G | G | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | I | I | S | L | C | P | K | N | S | S | I | I | R | H | A | L | L | A | K | L | V | L | F | P | E | N | T | A | D | S | L | N | E | V | L | A | A | Y | K | N | T | L | D | L | C | S | Q | D | S | V | L | K | I | N | L | S | K | L | F | T | L | H | S | C | L | S | L | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | Q | R | L | G | Y | G | D | V | S | K | R | M | Y | Q | E | I | F | V | P | D | S | D | A | D | I | T | P | L | S | F | I | I | S | W | T | A | L | N | T | F | A | P | I | C | T | S | E | N | D | V | V | E | K | M | A | M | Y | V | R | T | A | I | G | T | L | K | I | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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