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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5gmtB_ | 1.77 | PDB header: lyase | Chain: B: PDB Molecule: alginate lyase; |
Added to library: Thu Feb 9 17:44:35 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | T | T | V | W | S | L | S | S | V | P | H | S | S | H | V | S | T | I | L | G | H | F | K | P | I | Y | H | D | W | G | D | D | S | I | S | T | S | T | K | H | S | S | S | R | A | L | R | I | F | Y | E | K | G | S | Y | S | K | V | H | D | H | R | G | A | G | F | Y | S | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | G | G | G | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | B | T | T | B | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | S | A | I | S | S | S | V | D | A | M | I | L | K | Y | D | V | Y | F | E | N | F | G | F | G | I | G | G | K | L | P | G | L | F | G | G | E | N | G | E | G | A | Y | K | C | S | G | G | S | N | P | S | S | C | F | S | L | R | L | M | W | R | K | D | G | D | G | E | L | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | S | G | G | G | G | B | T | T | B | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | Y | I | P | T | N | Q | E | S | G | F | K | D | R | D | D | V | I | A | H | S | T | Y | G | Q | S | L | G | R | G | K | F | R | F | M | N | N | K | W | H | S | I | S | E | E | V | H | I | N | T | V | G | K | T | D | G | W | V | K | I | C | V | Q | A | E | G | H | S | Q | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . |
Sequence | C | Y | T | A | N | H | L | R | M | R | N | T | N | S | H | H | L | R | G | M | F | F | S | T | F | F | G | G | S | E | K | S | Y | A | A | P | N | D | C | Y | S | Y | F | K | N | F | Q | I | L | T | P | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | B | S | S | S | G | G | G | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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