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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5gkeB_ | 2.40 | PDB header: hydrolase/dna | Chain: B: PDB Molecule: endonuclease endoms; |
Added to library: Thu Feb 9 15:36:45 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | K | D | K | V | T | V | I | T | S | P | S | T | E | E | L | V | S | L | V | N | S | A | L | L | E | E | A | M | L | T | I | F | A | R | C | K | V | H | Y | D | G | R | A | K | S | E | L | G | S | G | D | R | V | I | I | V | K | P | D | G | S | F | L | I | H | Q | S | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | E | P | V | N | W | Q | P | P | G | S | R | V | R | L | E | L | R | E | N | P | V | L | V | S | I | R | R | K | P | R | E | T | L | E | V | E | L | E | E | V | Y | M | V | S | V | F | R | A | E | D | Y | E | E | L | A | L | T | G | S | E | A | E | M | A | E | L | I | F | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | P | E | V | I | E | P | G | F | K | P | L | F | R | E | K | A | I | G | T | G | I | V | A | V | L | G | R | D | S | D | G | N | I | V | V | L | E | L | K | R | R | R | A | E | L | H | A | V | R | Q | L | K | S | Y | V | E | I | L | R | E | E | Y | G | D | K | V | R | G | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | V | A | P | S | L | T | S | G | A | K | R | L | L | E | K | E | G | L | E | F | R | K | L | E | P | P | K | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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