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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ghrC_ | 2.51 | PDB header: dna binding protein/replication | Chain: C: PDB Molecule: ssdna-specific exonuclease; |
Added to library: Thu Feb 9 14:25:46 2017 | |
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Sequence | X | D | K | E | A | F | L | E | R | V | R | E | G | A | E | L | I | K | X | H | I | E | L | G | H | T | I | R | L | I | S | H | R | D | A | D | G | I | T | A | G | A | I | L | A | K | A | V | A | R | E | G | G | T | F | Q | L | S | I | V | K | Q | V | S | E | E | L | I | D | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | A | R | E | K | R | E | I | Y | V | F | S | D | L | G | S | G | S | I | E | L | I | E | E | K | L | N | F | A | T | V | V | V | A | D | H | H | P | P | E | K | D | S | F | S | T | D | S | H | V | L | V | N | P | V | P | F | G | A | N | S | V | R | D | L | S | G | S | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | Y | F | V | A | R | E | X | N | R | K | N | R | D | X | A | Y | V | A | I | V | G | A | V | G | D | X | Q | E | I | D | G | T | F | H | G | L | N | L | E | I | I | E | D | G | K | E | L | G | I | L | E | V | R | K | E | L | R | L | F | G | R | E | S | R | P | L | Y | Q | X |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | A | Y | A | T | N | P | E | I | P | E | I | T | G | D | E | R | K | A | I | E | W | L | R | A | K | G | F | D | P | E | X | K | Y | W | Q | L | R | E | E | E | K | R | K | L | H | E | A | L | L | V | H | X | I | K | H | G | A | P | K | E | A | I | D | R | L | I | G | D | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | B | G | G | G | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . |
Sequence | V | I | S | P | L | Y | P | E | G | D | V | R | H | E | A | R | E | F | A | T | L | L | N | A | T | G | R | L | N | A | G | T | L | G | V | A | I | C | L | G | D | E | E | A | Y | K | V | A | R | K | X | L | D | D | Y | K | K | E | Q | I | E | A | R | K | ||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | G | G | G | B | T | T | T | T |
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