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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5fq3B_ | 3.10 | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: bt_2262; |
Added to library: Thu Feb 9 16:21:20 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | V | T | L | E | R | E | G | D | E | K | I | V | L | E | K | G | Q | P | F | V | E | P | G | Y | Y | A | E | M | N | G | E | D | I | T | E | S | V | Q | I | K | G | S | V | D | V | N | T | P | G | I | Y | N | L | V | Y | A | A | Y | N | E | D | G | F | A | K | T | F | T | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | V | Y | V | A | D | N | T | A | S | P | L | K | S | G | I | Y | T | V | A | E | G | S | K | R | T | A | P | S | V | V | A | F | S | G | Y | E | I | V | I | F | Q | M | E | P | G | I | F | Y | I | S | D | F | L | G | G | W | Y | D | Q | R | A | G | Y | G | P | D | Y | A | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | V | G | K | F | E | L | N | D | D | N | T | I | T | P | L | E | S | Y | V | A | G | W | G | D | S | M | D | Q | M | T | N | T | L | L | D | P | A | T | G | T | L | K | W | T | V | A | Y | A | G | Q | L | S | F | D | I | I | V | K | Q | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | B | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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