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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5f3qB_ | 2.10 | PDB header: rna binding protein | Chain: B: PDB Molecule: putative uncharacterized protein; |
Added to library: Thu Feb 9 12:43:00 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | S | S | T | T | L | H | N | A | X | Q | Y | T | A | F | D | V | L | S | S | I | L | N | L | X | K | A | D | P | L | Y | D | L | L | D | Q | E | Y | E | K | N | E | F | Y | G | D | S | Y | L | E | E | R | A | S | S | L | V | L | K | F | L | R | K | Y | E | Q | I | P | F | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | G | G | G | G | G | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | X | Y | S | G | L | R | I | H | T | V | K | N | Q | T | L | G | E | I | F | D | L | L | H | L | E | K | K | K | K | G | D | L | V | E | S | L | I | G | G | C | V | L | L | S | Q | R | E | N | A | T | L | F | L | L | F | A | H | A | L | I | D | Y | I | F | Y | H | S | S | Y | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Y | F | N | A | N | P | P | K | L | V | K | E | E | I | I | T | D | I | Q | N | W | F | K | D | K | L | F | Y | Y | R | S | S | L | E | K | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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