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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5edlA_ | 1.95 | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: putative hmp/thiamine permease protein ykoe; |
Added to library: Thu Feb 9 21:27:44 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | W | K | V | K | E | I | V | I | M | S | V | I | S | I | V | F | A | V | V | Y | L | L | F | T | H | F | G | N | V | L | A | G | M | F | G | P | I | A | Y | E | P | I | Y | G | I | W | F | I | V | S | V | I | A | A | Y | M | I | R | K | P | G | A | A | L | V | S | E | I | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | A | L | V | E | C | L | L | G | N | P | S | G | P | M | V | I | V | I | G | I | V | Q | G | L | G | A | E | A | V | F | L | A | T | R | W | K | A | Y | S | L | P | V | L | M | L | A | G | M | G | S | S | V | A | S | F | I | Y | D | L | F | V | S | G | Y | A | A | Y | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | G | Y | L | L | I | M | L | V | I | R | L | I | S | G | A | L | L | A | G | L | L | G | K | A | V | S | D | S | L | A | Y | T | G | V | L | N | G | M | A | L | G | K | E | L | K | K | K | R | K | R | A | S | E | H | A | S | L | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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