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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5d9gB_ | 2.15 | PDB header: protein binding | Chain: B: PDB Molecule: tip41-like protein; |
Added to library: Thu Feb 9 14:48:37 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | H | X | A | S | G | P | W | K | L | T | A | S | K | T | H | I | X | K | S | A | D | V | E | K | L | A | D | E | L | H | X | P | S | L | P | E | X | X | F | G | D | N | V | L | R | I | Q | H | G | S | G | F | G | I | E | F | N | A | T | D | A | L | R | C | V | N | N | Y | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | X | L | K | V | A | C | A | E | E | W | Q | E | S | R | T | E | G | E | H | S | K | E | V | I | K | P | Y | D | W | T | Y | T | T | D | Y | K | G | T | L | L | G | E | S | L | K | L | K | V | V | P | T | T | D | H | I | D | T | E | K | L | K | A | R | E | Q | I | K | F | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | E | V | L | L | F | E | D | E | L | H | D | H | G | V | S | S | L | S | V | K | I | R | V | X | P | S | S | F | F | L | L | L | R | F | F | L | R | I | D | G | V | L | I | R | X | N | D | T | R | L | Y | H | E | A | D | K | T | Y | X | L | R | E | Y | T | S | R | E | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | I | S | S | L | X | H | V | P | P | S | L | F | T | E | P | N | E | I | S | Q | Y | L | P | I | K | E | A | V | C | E | K | L | I | F | P | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | G | G | G | G | G | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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