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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5b5yA_ | 1.75 | PDB header: metal binding protein | Chain: A: PDB Molecule: ptlcib4; |
Added to library: Thu Feb 9 13:32:24 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | L | T | A | V | K | K | A | F | P | D | A | L | T | N | A | E | L | V | A | M | V | S | K | R | L | S | Q | F | G | Y | H | K | Y | N | T | L | L | A | T | S | L | C | S | D | E | V | T | R | P | L | E | Q | D | F | G | E | V | Y | G | K | H | F | T | M | G | G | L | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | B | S | S | G | G | G | S | B | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | P | F | G | G | L | T | G | F | G | A | M | A | G | H | I | P | D | G | G | S | C | L | L | I | Y | G | S | H | V | G | V | S | W | E | G | K | W | G | T | V | A | R | R | G | R | E | K | G | G | A | C | C | G | S | A | V | A | A | A | Q | A | V | T | Q | A | Y | Q | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | B | T | T | B | T | B | T | T | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | P | L | D | A | Q | Q | G | Y | V | R | D | M | L | R | P | Y | A | A | T | L | S | E | A | E | D | V | M | V | T | L | P | V | S | V | Y | D | A | Q | Q | K | L | V | T | R | I | L | D | E | G | S | N | H | I | D | G | D | G | Q | I | A | V | V | G | G | I | Q | I | N | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | S | S | T | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | P | K | E | M | S | D | F | F | V | V | R | R | F | C | I | R | D | S | S | G | N | M | V | E | N | F | M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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