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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5a3jF_ | 2.78 | PDB header: oxidoreductase | Chain: F: PDB Molecule: putative quinone-oxidoreductase homolog, chloroplastic; |
Added to library: Thu Feb 9 17:52:59 2017 | |
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Sequence | G | K | L | M | H | A | L | Q | Y | N | S | Y | G | G | G | A | A | G | L | E | H | V | Q | V | P | V | P | T | P | K | S | N | E | V | C | L | K | L | E | A | T | S | L | N | P | V | D | W | K | I | Q | K | G | M | I | R | P | F | L | P | R | K | F | P | C | I | P | A | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | A | G | E | V | V | E | V | G | S | G | V | K | N | F | K | A | G | D | K | V | V | A | V | L | S | H | L | G | G | G | G | L | A | E | F | A | V | A | T | E | K | L | T | V | K | R | P | Q | E | V | G | A | A | E | A | A | A | L | P | V | A | G | L | T | A | L | Q | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | S | B | S | G | G | G | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | N | P | A | G | L | K | L | D | G | T | G | K | K | A | N | I | L | V | T | A | A | S | G | G | V | G | H | Y | A | V | Q | L | A | K | L | A | N | A | H | V | T | A | T | C | G | A | R | N | I | E | F | V | K | S | L | G | A | D | E | V | L | D | Y | K | T | P | E | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | L | K | S | P | S | G | K | K | Y | D | A | V | V | H | C | A | N | G | I | P | F | S | V | F | E | P | N | L | S | E | N | G | K | V | I | D | I | T | P | G | P | N | A | M | W | T | Y | A | V | K | K | I | T | M | S | K | K | Q | L | V | P | L | L | L | I | P | K | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | N | L | E | F | M | V | N | L | V | K | E | G | K | V | K | T | V | I | D | S | K | H | P | L | S | K | A | E | D | A | W | A | K | S | I | D | G | H | A | T | G | K | I | I | V | E | P | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | T | S | S |
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