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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3q0xA_ | PDB header: structural protein | Chain: A: PDB Molecule: centriole protein; | PDBTitle: n-terminal coiled-coil dimer domain of c. reinhardtii sas-6 homolog2 bld12p |
Added to library: Sat Feb 12 08:43:20 2011 | |
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Sequence | F | D | L | S | T | A | T | T | L | F | W | R | P | V | P | V | H | V | K | Q | Q | D | R | E | D | V | L | E | E | L | T | F | R | I | L | T | G | V | A | K | Q | N | H | N | L | R | I | L | R | I | H | I | S | S | D | S | D | L | F | F | L | H | T | L | E | V | S | E | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | Q | S | L | K | N | D | Q | G | I | L | V | D | F | A | S | F | P | G | K | I | I | S | L | L | E | K | C | I | L | A | Q | P | G | D | S | P | R | F | Q | A | V | L | T | I | R | G | G | E | S | V | F | K | I | V | E | I | N | D | E | K | Q | L | P | H | I | T | L | A | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | R | P | G | N | D | S | V | V | K | Q | F | L | A | F | R | L | S | E | V | K | G | T | C | H | D | L | S | D | D | L | S | R | T | R | D | D | R | D | S | M | V | A | Q | L | A | Q | C | R | Q | Q | L | A | Q | L | R | E | Q | Y | D | K | H | L | L | E | V | Q | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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