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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3k2sA_ | UNK | PDB header: lipid binding protein | Chain: A: PDB Molecule: apolipoprotein a-i; |
Added to library: Sat Apr 24 08:34:24 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | E | P | P | Q | S | P | W | D | R | V | K | D | L | A | T | V | Y | V | D | V | L | K | D | S | G | R | D | Y | V | S | Q | F | E | G | S | A | L | G | K | Q | L | N | L | K | L | L | D | N | W | D | S | V | T | S | T | F | S | K | L | R | E | Q | L | G | P | V | T | Q | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S | T | T | T | G | G | G | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | W | D | N | L | E | K | E | T | E | G | L | R | Q | E | M | S | K | D | L | E | E | V | K | A | K | V | Q | P | Y | L | D | D | F | Q | K | K | W | Q | E | E | M | E | L | Y | R | Q | K | V | E | P | L | R | A | E | L | Q | E | G | A | R | Q | K | L | H | E | L | Q | E | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | S | P | L | G | E | E | M | R | D | R | A | R | A | H | V | D | A | L | R | T | H | L | A | P | Y | S | D | E | L | R | Q | R | L | A | A | R | L | E | A | L | K | E | N | G | G | A | R | L | A | E | Y | H | A | K | A | T | E | H | L | S | T | L | S | E | K | A | K | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | L | E | D | L | R | Q | G | L | L | P | V | L | E | S | F | K | V | S | F | L | S | A | L | E | E | Y | T | K | K | L | N | T | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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