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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3fqiA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: protein dom3z; | PDBTitle: crystal structure of the mouse dom3z |
Added to library: Tue Mar 16 12:39:42 2010 | |
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Sequence | S | L | R | T | Q | P | S | L | Y | S | G | P | F | P | F | Y | R | R | P | S | E | L | G | C | F | S | L | D | A | Q | R | Q | Y | H | G | D | A | R | A | L | R | Y | Y | S | P | P | P | P | D | F | D | L | R | D | G | Y | P | D | R | Y | Q | P | R | D | E | E | V | Q | E | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | G | S | S | B | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | D | H | L | L | R | W | V | L | E | H | R | N | Q | G | W | L | A | G | A | T | V | T | W | R | G | H | L | T | K | L | L | T | T | P | Y | E | R | Q | E | G | W | Q | L | A | A | S | R | F | Q | G | T | L | Y | L | S | E | V | E | T | P | A | A | R | A | Q | R | L | A | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | G | G | G | G | G | G | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | P | L | L | R | E | L | M | Y | M | G | Y | K | F | E | Q | Y | M | C | A | D | K | P | G | G | S | P | D | P | S | G | E | V | N | T | N | V | A | Y | C | S | V | L | R | S | R | L | G | N | H | P | L | L | F | S | G | E | V | D | C | L | N | P | Q | A | P | C | T | Q | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | S | C | Y | V | E | L | K | T | S | K | E | M | H | S | P | G | Q | W | R | S | F | Y | R | H | K | L | L | K | W | W | A | Q | S | F | L | P | G | V | P | H | V | V | A | G | F | R | N | P | E | G | F | V | C | S | L | K | T | F | P | T | M | E | M | F | E | N | V | R | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | G | G | G | G | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | D | R | E | G | W | N | P | S | V | C | M | N | F | C | A | A | F | L | S | F | A | Q | S | T | V | V | Q | D | D | P | R | L | V | H | L | F | S | W | E | P | G | G | P | V | T | V | S | V | H | R | D | A | P | Y | A | F | L | P | S | W | Y | V | E | T | M | T | Q | D | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | T | T | T | T | S | B | S | T | T | T | S |
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