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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2v71A_ | PDB header: nuclear protein | Chain: A: PDB Molecule: nuclear distribution protein nude-like 1; | PDBTitle: coiled-coil region of nudel |
Added to library: Tue Mar 16 14:41:16 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | F | S | S | L | K | E | E | T | A | Y | W | K | E | L | S | X | K | Y | K | Q | S | F | Q | E | A | R | D | E | L | V | E | F | Q | E | G | S | R | E | L | E | A | E | L | E | A | Q | L | V | Q | A | E | Q | R | N | R | D | L | Q | A | D | N | Q | R | L | K | Y | E | V | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | L | K | E | K | L | E | H | Q | Y | A | Q | S | Y | K | Q | V | S | V | L | E | D | D | L | S | Q | T | R | A | I | K | E | Q | L | H | K | Y | V | R | E | L | E | Q | A | N | D | D | L | E | R | A | K | R | A | T | I | X | S | L | E | D | F | E | Q | R | L | N | Q | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | R | N | A | F | L | E | S | E | L | D | E | K | E | S | L | L | V | S | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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