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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2of3A_ | PDB header: structural protein, cell cycle | Chain: A: PDB Molecule: zyg-9; | PDBTitle: tog domain structure from c.elegans zyg9 |
Added to library: Tue Mar 16 13:16:40 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | E | L | L | L | S | D | N | E | D | K | K | Q | R | I | K | E | E | K | Q | L | K | L | V | K | W | N | F | Q | A | P | T | D | E | H | I | S | Q | L | Q | T | L | L | G | N | Q | A | K | V | S | L | M | S | Q | L | F | H | K | D | F | K | Q | H | L | A | A | L | D | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | B | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | R | L | A | D | T | S | P | R | S | L | L | S | N | S | D | L | L | L | K | W | C | T | L | R | F | F | E | T | N | P | A | A | L | I | K | V | L | E | L | C | K | V | I | V | E | L | I | R | D | T | E | T | P | M | S | Q | E | E | V | S | A | F | V | P | Y | L | L | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | G | E | A | K | D | N | M | R | T | S | V | R | D | I | V | N | V | L | S | D | V | V | G | P | L | K | M | T | P | M | L | L | D | A | L | K | S | K | N | A | R | Q | R | S | E | C | L | L | V | I | E | Y | Y | I | T | N | A | G | I | S | P | L | K | S | L | S | V | E | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | S | S | G | G | G | S | S | G | G | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | T | V | A | P | F | V | G | D | K | D | V | N | V | R | N | A | A | I | N | V | L | V | A | C | F | K | F | E | G | D | Q | M | W | K | A | A | G | R | M | A | D | K | D | K | S | L | V | E | E | R | I | K | R | T | G | V | ||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | S | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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