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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2kn4A_ | PDB header: rna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: immunoglobulin g-binding protein g, splicing factor; | PDBTitle: the structure of the rrm domain of sc35 |
Added to library: Sun Aug 29 04:39:12 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | Q | Y | K | L | I | L | N | G | K | T | L | K | G | E | T | T | T | E | A | V | D | A | A | T | A | E | K | V | F | K | Q | Y | A | N | D | N | G | V | D | G | E | W | T | Y | D | D | A | T | K | T | F | T | V | T | E | G | S | H | H | H | H | H | H | M | D | V | E | G | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | S | L | K | V | D | N | L | T | Y | R | T | S | P | D | T | L | R | R | V | F | E | K | Y | G | R | V | G | D | V | Y | I | P | R | D | R | Y | T | K | E | S | R | G | F | A | F | V | R | F | H | D | K | R | D | A | E | D | A | M | D | A | M | D | G | A | V | L | D | G | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | B | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | L | R | V | Q | M | A | R | Y | G | R | P | P | D | S | H | H | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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