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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2f3jA_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: rna and export factor binding protein 2; | PDBTitle: the solution structure of the ref2-i mrna export factor2 (residues 1-155). |
Added to library: Tue Mar 16 13:14:56 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | A | D | K | M | D | M | S | L | D | D | I | I | K | L | N | R | N | Q | R | R | V | N | R | G | G | G | P | R | R | N | R | P | A | I | A | R | G | G | R | N | R | P | A | P | Y | S | R | P | K | P | L | P | D | K | W | Q | H | D | L | F | D | S | G | C | G | G | G | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | E | T | G | A | K | L | L | V | S | N | L | D | F | G | V | S | D | A | D | I | Q | E | L | F | A | E | F | G | T | L | K | K | A | A | V | D | Y | D | R | S | G | R | S | L | G | T | A | D | V | H | F | E | R | R | A | D | A | L | K | A | M | K | Q | Y | K | G | V | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | G | R | P | M | D | I | Q | L | V | A | S | Q | I | D | L | E | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | S | S | G | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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