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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1qm9A_ | PDB header: ribonucleoprotein | Chain: A: PDB Molecule: polypyrimidine tract-binding protein; | PDBTitle: nmr, representative structure |
Added to library: Tue Mar 16 14:10:48 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | G | N | S | V | L | L | V | S | N | L | N | P | E | R | V | T | P | Q | S | L | F | I | L | F | G | V | Y | G | D | V | Q | R | V | K | I | L | F | N | K | K | E | N | A | L | V | Q | M | A | D | G | N | Q | A | Q | L | A | M | S | H | L | N | G | H | K | L | H | G | K | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | R | I | T | L | S | K | H | Q | N | V | Q | L | P | R | E | G | Q | E | D | Q | G | L | T | K | D | Y | G | N | S | P | L | H | R | F | K | K | P | G | S | K | N | F | Q | N | I | F | P | P | S | A | T | L | H | L | S | N | I | P | P | S | V | S | E | E | D | L | K | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | F | S | S | N | G | G | V | V | K | G | F | K | F | F | Q | K | D | R | K | M | A | L | I | Q | M | G | S | V | E | E | A | V | Q | A | L | I | D | L | H | N | H | D | L | G | E | N | H | H | L | R | V | S | F | S | K | S | T | I | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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