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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1ik9B_ | PDB header: gene regulation/ligase | Chain: B: PDB Molecule: dna repair protein xrcc4; | PDBTitle: crystal structure of a xrcc4-dna ligase iv complex |
Added to library: Tue Mar 16 13:48:22 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | E | R | K | I | S | R | I | H | L | V | S | E | P | S | I | T | H | F | L | Q | V | S | W | E | K | T | L | E | S | G | F | V | I | T | L | T | D | G | H | S | A | W | T | G | T | V | S | E | S | E | I | S | Q | E | A | D | D | M | A | M | E | K | G | K | Y | V | G | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | K | A | L | L | S | V | Y | T | F | N | F | S | K | E | S | A | Y | F | F | F | E | K | N | L | K | D | V | S | F | R | L | G | S | F | N | L | E | K | V | E | N | P | A | E | V | I | R | E | L | I | A | Y | A | L | D | T | I | A | E | N | Q | A | K | N | E | H | L | Q | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | E | N | E | R | L | L | R | D | W | N | D | V | Q | G | R | F | E | K | A | V | S | A | K | E | A | L | E | T | D | L | Y | K | R | F | I | L | V | L | N | E | K | K | T | K | I | R | S | L | H | N | K | L | L | N | A | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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