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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1b7fA_ | PDB header: rna-binding protein/rna | Chain: A: PDB Molecule: protein (sxl-lethal protein); | PDBTitle: sxl-lethal protein/rna complex |
Added to library: Tue Mar 16 13:36:28 2010 | |
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Sequence | S | N | T | N | L | I | V | N | Y | L | P | Q | D | M | T | D | R | E | L | Y | A | L | F | R | A | I | G | P | I | N | T | C | R | I | M | R | D | Y | K | T | G | Y | S | Y | G | Y | A | F | V | D | F | T | S | E | M | D | S | Q | R | A | I | K | V | L | N | G | I | T | V | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | K | R | L | K | V | S | Y | A | R | P | G | G | E | S | I | K | D | T | N | L | Y | V | T | N | L | P | R | T | I | T | D | D | Q | L | D | T | I | F | G | K | Y | G | S | I | V | Q | K | N | I | L | R | D | K | L | T | G | R | P | R | G | V | A | F | V | R | Y | N | K | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | E | E | A | Q | E | A | I | S | A | L | N | N | V | I | P | E | G | G | S | Q | P | L | S | V | R | L | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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