Classification of alpha-alpha loops

Class	CN	D	Delta	Theta	Rho	NR	RMSD(Å)	Consensus	Nomenclature
aa{}aa (23 loops)	0.1.1	3	45-90	0-45	135-180	1	1.3 ± 0.7	hXXX aaaa	Kinked helix
	0.1.2	3	45-90	0-45	90-135	1	0.7 ± 0.4	XpxH aaaa	Kinked helix
	0.1.3	5	0-45	0-45	90-135	1	1.8 ± 0.7	XXXX aaaa	Kinked helix
	0.1.4	5	0-45	45-90	45-90	1,2,3	1.7 ± 0.8	XXXh aaaa	Kinked helix
aa{b}aa (48 loops)	1.1.1	5	45-90	90-135	90-135	1,2	1.2 ± 0.5	XXXpX aabaa	aBa
	1.1.2	5	45-90	45-90	180-225	1	0.9 ± 0.3	hpSpX aabaa	aBa
	1.1.3	7	0-45	45-90	180-225	1,2,3	1.4 ± 0.8	XpXXX aabaa	aBa
	1.1.4	7	45-90	90-135	90-135	1,2	1.2 ± 0.2	XXpPp aabaa	aBa
	1.1.5	7	0-45	45-90	90-135	1,3	2.7 ± 0.6	ppphX aabaa	aBa
	1.1.6	7	45-90	90-135	90-135	2,4	1.8 ± 0.3	hpphp aabaa	aBa
	1.1.7	9	90-135	45-90	45-90	3	1.1 ± 0.2	XppPp aabaa	aBa
	1.1.8	9	45-90	135-180	90-135	3,4	2.1 ± 0.9	hpDhp aabaa	aBa
aa{l}aa (11 loops)	1.2.1	5	45-90	90-135	90-135	2	0.8 ± 0.3	pDGhh aalaa	aGa
	1.2.2	7	90-135	90-135	45-90	2	1.2 ± 0.4	ppGXX aalaa	aGa
	1.2.3	7	45-90	90-135	45-90	2,3,4	1.1 ± 0.4	pXhXp aalaa	aGa
aa{p}aa (4 loops)	1.3.1	5	0-45	45-90	180-225	1	1.2 ± 0.7	XppPp aapaa	aBa
aa{bp}aa (5 loops)	2.1.1	9	45-90	135-180	45-90	2,3	1.3 ± 0.4	XphXXX aabpaa	aBBa
aa{lb}aa (4 loops)	2.2.1	7	45-90	135-180	135-180	3,4	1.2 ± 0.7	pppXhp aalbaa	aGBa
aa{lbb}aa (26 loops)	3.1.1	9	90-135	90-135	0-45	5,6	2.0 ± 0.4	XXXhphp aalbbaa	aGBBa
	3.1.2	9	90-135	90-135	315-360	3,4	2.2 ± 0.7	pXphXXX aalbbaa	aGBBa
	3.1.3	11	90-135	90-135	0-45	3,4,5	2.0 ± 0.8	phXXXhp aalbbaa	aGBBa
aa{lbp}aa (10 loops)	3.2.1	9	45-90	135-180	315-360	4,5,6	2.3 ± 0.9	XXXXpXX aalbpaa	aGBBa
aa{baabb}aa (6 loops)	5.1.1	11	90-135	90-135	315-360	4,5,6	1.6 ± 0.7	pphPphppX aabaabbaa	aBAABBa

Last modified: 09-September-1997