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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d2r7ca2 | Rotavirus NSP2 fragment, N-terminal domain | Rotavirus NSP2 fragment, N-terminal domain | Rotavirus NSP2 fragment, N-terminal domain |
Added to library: Tue Mar 16 13:35:43 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | E | L | A | C | F | C | Y | P | H | L | E | N | D | S | Y | K | F | I | P | F | N | N | L | A | I | K | A | M | L | T | A | K | V | D | K | K | D | M | D | K | F | Y | D | S | I | I | Y | G | I | A | P | P | P | Q | F | K | K | R | Y | N | T | N | D | N | S | R | G | M | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | G | G | B | B | T | T | B | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | E | T | I | M | F | T | K | V | A | M | L | I | C | E | A | L | N | S | L | K | V | T | Q | A | N | V | S | N | V | L | S | R | V | V | S | I | R | H | L | E | N | L | V | I | R | K | E | N | P | Q | D | I | L | F | H | S | K | D | L | L | L | K | S | T | L | I | A | I | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | B | T | T | T | T | B | T | T | T | S | G | G | G | T | T | T |   | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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