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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d2j3wb1 | Ligand-binding domain in the NO signalling and Golgi transport | Ligand-binding domain in the NO signalling and Golgi transport | TRAPP components |
Added to library: Tue Mar 16 12:14:31 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | T | E | V | S | V | S | A | F | A | L | L | F | S | E | M | V | Q | Y | C | Q | S | R | V | Y | S | V | S | E | L | Q | A | R | L | A | D | M | G | Q | G | V | G | A | S | L | L | D | V | L | V | M | R | E | K | N | G | K | R | E | T | K | V | L | N | I | L | L | F | I | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | N | V | W | K | A | L | F | G | K | E | A | D | K | L | E | Q | A | N | D | D | D | K | T | Y | Y | I | I | E | K | E | P | L | I | N | A | Y | I | S | V | P | K | E | N | S | T | L | N | C | A | A | F | T | G | G | I | V | E | A | I | L | T | H | S | G | F | P | A | K | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | G | T | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | T | V | H | W | H | K | G | T | T | L | M | I | K | F | D | E | S | V | I | A | R | D | K | A | L | D | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T |
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