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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d2icwg1 | Superantigen MAM | Superantigen MAM | Superantigen MAM |
Added to library: Tue Mar 16 13:27:52 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | K | L | R | V | E | N | P | K | K | A | Q | K | H | F | V | Q | N | L | N | N | V | V | F | T | N | K | E | L | E | D | I | Y | N | L | S | N | K | E | E | T | K | E | V | L | K | L | F | K | L | K | V | N | Q | F | Y | R | H | A | F | G | I | V | N | D | Y | N | G | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | Y | K | E | I | F | N | M | M | F | L | K | L | S | V | V | F | D | T | Q | R | K | E | A | N | N | V | E | Q | I | K | R | N | I | A | I | L | D | E | I | M | A | K | A | D | N | D | L | S | Y | F | I | S | Q | N | K | N | F | Q | E | L | W | D | K | A | V | K | L | T | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | M | K | I | K | L | K | G | Q | K | L | D | L | R | D | G | E | V | A | I | N | K | V | R | E | L | F | G | S | D | K | N | V | K | E | L | W | W | F | R | S | L | L | V | K | G | V | Y | L | I | K | R | Y | Y | E | G | D | I | E | L | K | T | T | S | D | F | A | K | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | G | S | S |   | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | E | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
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