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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d2i6ea1 | Periplasmic binding protein-like II | Periplasmic binding protein-like II | Phosphate binding protein-like |
Added to library: Tue Mar 16 14:36:33 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | Y | R | A | G | W | I | H | F | T | N | V | A | P | I | L | D | S | L | E | L | P | P | G | V | T | A | I | T | G | V | P | T | Q | X | N | A | A | L | L | S | G | E | V | D | I | A | N | V | S | A | V | E | F | I | R | H | A | D | T | L | A | A | L | P | D | F | S | V | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | L | G | P | V | Y | S | V | N | L | F | H | T | C | P | L | P | E | L | R | R | V | A | L | T | S | Q | S | A | X | S | V | A | L | L | E | V | L | L | R | Q | K | G | L | S | P | V | L | E | R | A | E | G | T | A | E | S | L | L | A | A | G | Y | D | G | V | L | R | I | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | D | A | L | R | E | W | Y | G | V | V | G | P | L | T | P | E | R | T | X | T | S | L | P | H | T | G | R | G | I | T | V | T | D | L | A | Q | E | W | F | D | L | T | G | H | P | F | T | F | A | V | W | A | Y | R | K | D | N | P | P | P | A | A | L | L | Q | A | X | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . |
Sequence | A | R | R | R | G | I | G | H | L | A | E | V | S | Q | R | H | A | E | K | L | G | L | P | E | R | V | V | Q | H | Y | L | W | N | F | R | Y | H | L | E | A | P | D | R | L | G | L | R | E | F | A | D | L | A | V | P | G | H | A | E | L | T | F | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | B | S | S | T | T |
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