|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
---|---|---|---|
d2hhva1 | Ribonuclease H-like motif | Ribonuclease H-like | DnaQ-like 3'-5' exonuclease |
Added to library: Tue Mar 16 12:56:24 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | K | M | A | F | T | L | A | D | R | V | T | E | E | M | L | A | D | K | A | A | L | V | V | E | V | V | E | E | N | Y | H | D | A | P | I | V | G | I | A | V | V | N | E | H | G | R | F | F | L | R | P | E | T | A | L | A | D | P | Q | F | V | A | W | L | G | D | E | T | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | S | M | F | D | S | K | R | A | A | V | A | L | K | W | K | G | I | E | L | C | G | V | S | F | D | L | L | L | A | A | Y | L | L | D | P | A | Q | G | V | D | D | V | A | A | A | A | K | M | K | Q | Y | E | A | V | R | P | D | E | A | V | Y | G | K | G | A | K | R | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | G | G | G | S | T | T | T | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | P | D | E | P | V | L | A | E | H | L | V | R | K | A | A | A | I | W | E | L | E | R | P | F | L | D | E | L | R | R | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|