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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d2d1ha1 | DNA/RNA-binding 3-helical bundle | "Winged helix" DNA-binding domain | TrmB-like |
Added to library: Tue Mar 16 13:24:02 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | X | K | E | K | L | E | S | K | K | D | E | I | R | C | C | Y | K | I | T | D | T | D | V | A | V | L | L | K | X | V | E | I | E | K | P | I | T | S | E | E | L | A | D | I | F | K | L | S | K | T | T | V | E | N | S | L | K | K | L | I | E | L | G | L | V | V | R | T | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | G | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | P | K | Y | Y | Y | S | I | S | S | N | I | L | E | K | I | R | N | D | L | L | N | C | A | K | R | X | E | L | A | A | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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