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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1vqob1 | Reductase/isomerase/elongation factor common domain | Translation proteins | Ribosomal protein L3 |
Added to library: Tue Mar 16 12:01:36 2010 | |
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Sequence | P | Q | P | S | R | P | R | K | G | S | L | G | F | G | P | R | K | R | S | T | S | E | T | P | R | F | N | S | W | P | S | D | D | G | Q | P | G | V | Q | G | F | A | G | Y | K | A | G | M | T | H | V | V | L | V | N | D | E | P | N | S | P | R | E | G | M | E | E | T | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | T | V | I | E | T | P | P | M | R | A | V | A | L | R | A | Y | E | D | T | P | Y | G | Q | R | P | L | T | E | V | W | T | D | E | F | H | S | E | L | D | R | T | L | D | V | P | E | D | H | D | P | D | A | A | E | E | Q | I | R | D | A | H | E | A | G | D | L | G | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | G | G | G | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | L | I | T | H | T | V | P | D | A | V | P | S | V | P | K | K | K | P | D | V | M | E | T | R | V | G | G | G | S | V | S | D | R | L | D | H | A | L | D | I | V | E | D | G | G | E | H | A | M | N | D | I | F | R | A | G | E | Y | A | D | V | A | G | V | T | K | G | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | S | S | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | Q | G | P | V | K | R | W | G | V | Q | K | R | K | G | K | H | A | R | Q | G | W | R | R | R | I | G | N | L | G | P | W | N | P | S | R | V | R | S | T | V | P | Q | Q | G | Q | T | G | Y | H | Q | R | T | E | L | N | K | R | L | I | D | I | G | E | G | D | E | P | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | D | G | G | F | V | N | Y | G | E | V | D | G | P | Y | T | L | V | K | G | S | V | P | G | P | D | K | R | L | V | R | F | R | P | A | V | R | P | N | D | Q | P | R | L | D | P | E | V | R | Y | V | S | N | E | S | N | Q | G | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | B | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S |
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